原序自序卷一脉论辨五脏六腑部位脉法辨人迎三部趺阳九候五脏六腑脉法诊诸病证脉法辨脉形及变化所主病证法卷二寒证热证风食风湿疟疾痹证劳伤气病血证卷三诸积诸痛眩晕厥证痰饮消证疸病卷四咳嗽喘证呕吐小便妇人科
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
张序卷之上一、天地六位脏象图（图缺）二、手足阴阳（一）手足三阴三阳（二）手三阴三阳（三）足三阴三阳三、五脏六腑，除心包络十一经脉证法（一）肝之经，肝脉本部在于筋，足厥阴，风，乙木也。（二）胆之经，足少
病机气宜保命集
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分第7部分
疔毒血痣骨槽风舌菌牙菌牙岩舌岩舌疳锁喉毒盘槽痈对口瘰失荣乳岩井疽蔽骨疽石疽疵疽附骨疽串臂漏肛漏肝痈附论肺痈漫心痈马刀肾俞发少腹痈缩脚痈流注肾岩脱囊伏兔痈眼胞痰瘤脾肚发肠覃胃脘痈舌根痈鹤膝风附论麻风论鸡
自序心部药队补心猛将北五味酸枣仁柏子仁远志肉丹参龙眼肉麦门冬当归次将白芍药茯苓神猪心血琥珀淮小麦合欢皮龙角泻心猛将牛黄石菖蒲黄连木通辰砂犀角次将山栀仁连翘通草车前子叶竹卷心灯心莲子心石莲子安息香乳香金
许氏医案
序卷一论疮疡二十六脉所主（一）论疮疡五善七恶主治（二）论疮疡当明本末虚实（三）论疮疡用针宜禁（四）论疮疡欲呕作呕（五）论疮疡用汗下药（六）论疮疡围寒凉之药（七）论疮疡泥用定痛散（八）论疮疡用生肌之药（