《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
简介序凡例卷首卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二
序叙论痈疽发背第一服药通变方第二荣卫返魂汤用敷贴温药第三冲和仙膏敷贴热药第四回阳玉龙膏敷贴凉药第五洪宝丹合用诸方第六黄矾丸柞木饮子三石散栝蒌散真君妙贴散追风丸搜损寻痛丸复煎散神锋散乌金散索血散葛根汤散
简介序卷上卷下
自序卷一调经门经水先期而来经水过期而来经行腹痛血风卷二血崩便浊白淫淋证白带血癖经准不孕热入血室卷三广嗣论胎前门受妊脉法男女脉法双胎脉法死胎脉法鬼胎脉法逐月胎形论妊娠调护法小产安胎卷四妊娠中风妊娠伤寒妊
序上卷正体主治大法扑伤之症治验血脱烦躁血虚发躁气虚血热瘀血泛注瘀血作痛肝火作痛肝火忿怒肝火胁胀肝胆虚症血虚腹痛气虚不溃寒凝不溃脾虚不敛血虚筋挛肾虚气逆湿热乘肝肝经郁火痛伤胃呕药伤胃呕气血不损行气之非下
普济本事方续集
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹