序卷上全论大法第一六经正义第二合并启微第三风寒辨惑第四温暑指归第五湿异同第六平脉准绳第七卷下大阳病解第一阳明病解第二少阳病解第三太阴病解第四少阴病解第五厥阴病解第六制方大法第七
本草征要
扁鹊神应鍼灸玉龙经
针灸节要
重订产孕集
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
原序上卷桂枝汤证桂枝汤证其一桂枝汤证其二桂枝汤证其三桂枝汤证其四（附列门人治验）桂枝汤证其五（附列门人治验）桂枝汤证其六（附列门人治验）麻黄汤证麻黄汤证其一麻黄汤证其二麻黄汤证其三麻黄汤证其四葛根汤证
卷一中风肝风眩晕头风虚劳卷二咳嗽吐血失音肺痿卷三遗精淋浊阳痿汗脱脾胃木乘土肿胀卷四积聚痞噎膈反胃噫嗳呕吐吐蛔不食肠痹便闭肺痹胸痹哮喘呃疸卷五风寒风温温热暑湿燥疫痧疹瘰痰痰饮卷六郁肝火不寐卷六三消脾瘅疟
经络统序原始脏腑联系分合详说脏腑联系分合详说手太阴肺经（左右共二十二穴）手阳明大肠经（左右共四十穴）足阳明胃经（左右共九十穴）足太阴脾经（左右共四十二穴）手少阴心经（左右共十八穴）手太阳小肠经（左右共