序总论伤寒总诀治法太阳经伤寒太阳经伤风阳明经分在经在腑阳明经经病阳明经腑病少阳经主中宜和解三阴经分传经直中太阴经传经热症太阴经直中寒症少阴经传热症少阴经直中寒症厥阴经传经热症厥阴经直中寒症结胸血结胸痞
小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
巢氏诸病源候总论
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
小引凡例卷上补可扶弱四君子汤六君子汤香砂六君子汤五味异功散香砂六君子汤论补中益气汤当归补血汤保元汤独参汤四物汤八珍汤十全大补汤人参养荣汤天王补心丹六味地黄丸桂附地黄丸还少丹龟鹿二仙胶圣愈汤十味地黄丸正
序卷一论集张景岳大宝论张景岳真阴论张景岳命门后论赵养葵火为先天论赵养葵水火论（三条）喻嘉言秋燥论张景岳虚损论（二则）张景岳论东垣脾胃论喻嘉言脉部位论赵羽皇参附宜虚论附∶格言一格言二格言三卷二脉要集《内
弁言序题词跋卷一卷二卷三卷四
序凡例卷一·慎疾法语省身修德卫生总要饮食宜忌养生铭保命箴寡欲说延年六字诀惜三宝益五脏先时加谨摄生要言勿药须知十二段动功行功六字静功解十二时病为善去疾吕祖治百病符卷二·杂症头疾面疾眼疾耳疾鼻病口病唇病舌
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄