一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
仁端录
简介序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十附录
灵枢九针十二原第一法本输第二法地小针解第三法人邪气藏府病形第四法时根结第五法音寿天刚柔第六法律官针第七法星本神第八法民终站第九法野经脉第十经别第十一经水第十二经筋第十三骨度第十四五十营第十五营气第十六
朱序张序前跋卷一守正辟邪论面部定位图解五轮八廓大略五轮解八廓解轮廓运气总论六气总论风寒暑湿燥火七情总论喜怒忧思悲恐惊卷二瞳神论心经主病肺经主病肝经主病脾经主病肾经主病三焦主病小肠主病胆经主病胃经主病大
裘序叶序原序卷上辨春夏秋冬温暑凉寒四证病原天时地气辨寒暑证各异暑证暑厥暑风暑疡暑瘵绞肠痧时疫（见朱丹溪）寒疫脉理五运六气五运配十干之年六气为司天之岁南政北政十二支年分运气增订客气客运活法卷中古今名医暑
简介序卷上卷下
石药尔雅
伤寒医鉴论脉证论六经传受论汗下论阳厥极深论湿热发黄论不得眠论呕吐论湿热下利论霍乱论好用寒药论小儿疮疹
自叙序凡例卷之一先天脉镜叙先天脉镜论云诊脉捷要歌照脉玄窍诀照脉口诀三焦照六腑脾照五脏十八脉形歌五运体性六气合来为邪脉左手太过脉右手太过脉左手不及脉诀右手不及脉诀调摄养生却妄远色贵达调息除烦节食慎劳酌饮