序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
自序卷上石膏滑石芒硝甘草黄人参桔梗术白头翁卷中黄连黄芩柴胡贝母细辛当归芎芍药牡丹皮茵陈蒿艾麻黄地黄葶苈大黄大戟甘遂附子半夏芫花五味子栝蒌实葛根防己卷下香豉泽泻薏苡仁薤白干姜杏仁大枣橘皮吴茱萸瓜蒂桂枝浓
自序一自序二卷上外症用刀针法火针不可轻用治筋缩法治足筋缩法浮皮兜脓须剪开升药所忌背部湿痰块痔漏疮鸡胸症龟背症虚人有病易昏愦病挟气郁宜审治少壮妇女病要法治孕妇病法时疫捷法（先看两肩有红点）产后治法大略温
黄帝素问宣明论方
简介杂病·自叙杂病·卷第一 诸中门·诸伤门·寒热门杂病·卷第二 诸气门杂病·卷第三 诸呕逆门·诸血门杂病·卷第四 诸痛门·痿痹门杂病·卷第五 诸风门·神志门·杂门杂病·卷第六 大小腑门杂病·卷第七 七
自序新刻难经悬解叙卷上一难二难三难四难五难六难七难八难九难十难十一难十二难十三难十四难十五难十六难十七难十八难十九难二十难二十一难二十二难二十三难二十四难二十五难二十六难二十七难二十八难二十九难三十难
第一册卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳发热潮热恶寒往来寒热外热内寒，外寒内热上热下寒，上寒下热疟厥第二册气郁痞水肿胀满积聚痰饮咳嗽喘短气第三册呕吐膈气呕吐反胃噎吐
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十
嘱言上编总论歌痈疽总论痈疽总论歌痈疽总论歌解痈疽阳症歌痈疽阴症歌阴阳相半歌痈疽善恶歌痈疽五善歌痈疽七恶歌诸般坏症歌中编处方篇锅烈制法金丹制法石青制法银翠制法附∶灵药释性第一方·中九丸第二方·金蚣丸第三