序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
简介序凡例九条卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九
正文浮沉迟数滑涩附载人迎气口脉法附载奇经八脉
前序卷上经候不调经漏不止经闭不行带下血分水分小便出血热入血室师尼寡妇寒热历节痛风（即白虎历节风）流注瘰乳痈乳岩血风疮疮阴疮（交接出血、阴挺、阴痒、阴虫附）附方并注卷下保胎小产保产子死腹中胎衣不出交骨不
脏腑虚实标本用药式
秘藏膏丹丸散方剂
广嗣五种备要
第1部分第2部分第3部分
前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一